В работах по созданию систем защиты на объектах информатизации АО «БИТК» в ряде случаев выступает в качестве головного исполнителя с привлечением специализированных организаций по защите информации или в качестве соисполнителя других организаций. В число привлекаемых к совместным работам входят организации, имеющие лицензии ФСБ России. В отдельных случаях могут привлекаться также отдельные специалисты, что позволяет качественно и в сжатые сроки выполнять работы по защите информации и обеспечению комплексной безопасности объектов информатизации.
При выборе организаций-соисполнителей предпочтение отдается организациям, продукция которых проходила сертификационные испытания в испытательной лаборатории АО «БИТК», а также предприятиям, прошедшим в АО «БИТК» специальную экспертизу на право осуществления деятельности в области технической защиты информации и ПД ИТР. Среди партнеров АО «БИТК» более 500 предприятий и организаций, в том числе крупные системные интеграторы, разработчики средств защиты объектов информатизации, различных технических средств, средств автоматизации и информатизации, программного обеспечения.